国子监的课程也会分为两大部分。第一部分为国学部分维持原有的课程不变，只做微小的调整，被命名为文科。第二部分为制学部分，主要是教授科学文化知识，定为理科。
以后每一个从这里毕业的学生都需要参加毕业考试，考试合格后颁发毕业证书。文科，理科成绩都要计入毕业成绩。只有文科，理科成绩全部合格，方能正式获得毕业证书，朝廷方可以授官。
两个月前，负责监国的朱厚炜罢免了原来的国子监祭酒，正式任命大儒蔡清为新任国子监祭酒，蔡清，字介夫，别号虚斋，明晋江人。三十一岁中进士，累官至南京文选郎中、江西提学副使，当代著名的理学家，儒客大家。
被调来国子监之前，蔡清是登莱行政学院第二任校长。他治学严谨，在床边设案置烛台，凡与学生讲论的问题，临寐前反复思考，若有所得即起床，点灯纪录备忘。
另外，朱厚炜还从登莱行政学院另外抽调来李廷机、张岳、林希元、 陈琛等二十八名教员成立国子监理科教研室，加入国子监教学工作，这二十八人都是登莱行政学院各学科的佼佼者，号称“登莱新学二十八宿”，在新学学员中名噪一时，很受学员喜爱。
简单的仪式后，在众人的簇拥下大家进入了国子监的教学区。齐王朱厚炜率先穿过一道色彩斑斓的牌坊，眼前出现了一个水池，水池中间有一名为“辟雍”的建筑。弘治十八年，孝宗朱祐樘命人在这里增建了这组皇家建筑，当时的弘治皇帝也打算改革国子监，在朝政不太忙的时候，他每月会抽一天时间来到这里给国子监的学生讲学。
“辟雍”四周建有一片圆形的池塘，以前弘治皇帝总会坐在正中央给学生讲学，学生们则跪坐在外面听。“辟雍”四周建有一片圆形的池塘，因为这儿是皇帝讲学的地点，讲堂等级必然得为全国最高的。有资格来听皇帝讲课的学子，大多都是皇帝选定的优秀学生，是那时候学生群体里的人上人。
今天，齐王就要在他父皇讲学的地方，发表他在国子监的第一场演讲，这种演讲的形式也是前所未有的，国子监的学生基本上都到齐了，除了监生以外，以蔡清为首的国子监教员，以及李东阳、焦芳等内阁成员以及六部各长官，均悉数到场聆听齐王殿下的演讲。
……
巳时三刻，太阳透过树叶洒在整个”辟雍”里，显得斑斑点点，别有一番意境。这里已经人头济济，那些年轻的学子脸上洋溢着兴奋的表情，已经很久没有皇帝（齐王代皇帝讲学）来这里讲学了。齐王的到来，意味着国子监重新受到了朝廷的重视，也意味着这些国子监的监生们有了更好的前途。你让他们如何不心情激动？
在座的人包括李东阳在内其他百官却是另外一种心境，他们更关注的是学术上的问题。所有人都明白齐王是新学的创始人之一，也不知道他将如何评价孔夫子。所有人都很期待，这位颇受争议的齐王将跟大家讲什么，他如何阐述儒家思想，或者还会一鸣惊人，发表什么让人瞠目的言论。
在众人的注视中，风度翩翩的朱厚炜身着一身雪白的儒士袍，衬托得他英气而儒雅，不用开口，光是这副形象就让国子监的学生们心折。他从容不迫地走上了讲台。与大家相互行过礼后，朱厚炜先没有开口说话，他提起一只巨大的毛笔刷刷刷运笔如风，在旁边那面雪白的照壁上写下了两行大字：
使有菽粟如水火，
能以天下为一家。
还没有开口，照壁上斗大的字，独一无二的书法，飘逸的字体就引来四下众人一片惊叹声。先声夺人后，朱厚炜放下这只如拖把一样的巨笔，表情轻松的再次走上讲台，脸上露出亲切的微笑，对众人说道：“本王很荣幸今天能代表皇帝陛下，祭祀我们华夏最伟大的思想家、教育家孔圣人，越了解孔夫子的为人，本王心中的感受也越多。很高兴有这个机会，跟在座的各位交流一下。”
说到这，他手环指一下四下众人，诚恳地说道：”毋庸置疑，今天在座的每一位贤才都是我大明的精英，或者是大明未来的栋梁之才。在座的有西涯先生、虚斋先生，这两位都是本王崇敬的国学大家。说实话，今天当着两位的面演讲，本王心中还是有些忐忑的。“
此言一出，引来一阵轻笑。笑声过后，齐王继续笑道：”呵呵，不过嘛，现在本王也是骑虎难下，只好班门弄斧，在这里跟大家聊一聊本王对孔圣人思想研究的一点心得，当然，仅代表本王的个人意见，欢迎诸位批评斧正。”
讲完开场白，朱厚炜喝了一口水，继续说道：“既然今天刚刚祭拜过孔圣人，本王就聊一聊论语和孔子的为人。在我看来，孔夫子之所以被称为圣人，之所以伟大，是因为孔夫子是中华传统文化源头的主要开拓者、奠基者，其人文精神流淌在一代又一代华夏子孙的血脉中，这一点，任何人，任何时候我们都不应该否认。”
说到这里，朱厚炜站起来踱了两步，心中酝酿了一下措辞，这才说道：“不过，如何把孔夫子的学问发扬光大？这是一个问题。孔夫子毕竟是生活在两千年前，时代发展了，社会也发生了变化。因此，本王认为学习孔子的学问应该要用科学的方法去理解，我们既有所传承，也要有所批判，要与时俱进，有所发展，有所创新。
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